Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C16orf70Q9BSU1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C16orf70Q9BSU1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C16orf70Q9BSU1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms