Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM175Q9BSA9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM175Q9BSA9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM175Q9BSA9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms