Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FYCO1Q9BQS8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FYCO1Q9BQS8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FYCO1Q9BQS8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FYCO1Q9BQS8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms