Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM4BQ9BQ04 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms