Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP2Q99959 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms