Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC6Q99741 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms