Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGRRF1Q99675 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGRRF1Q99675 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1Q99675 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGRRF1Q99675 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGRRF1Q99675 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CGRRF1Q99675 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGRRF1Q99675 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGRRF1Q99675 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms