Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC1Q99614 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC1Q99614 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms