Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGMNQ99538 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms