Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD180Q99467 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CD180Q99467 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD180Q99467 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD180Q99467 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD180Q99467 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD180Q99467 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD180Q99467 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD180Q99467 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD180Q99467 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CD180Q99467 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD180Q99467 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD180Q99467 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD180Q99467 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD180Q99467 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD180Q99467 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD180Q99467 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD180Q99467 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD180Q99467 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD180Q99467 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD180Q99467 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD180Q99467 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD180Q99467 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD180Q99467 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD180Q99467 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD180Q99467 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD180Q99467 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD180Q99467 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD180Q99467 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD180Q99467 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD180Q99467 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD180Q99467 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD180Q99467 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD180Q99467 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD180Q99467 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD180Q99467 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD180Q99467 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD180Q99467 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD180Q99467 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD180Q99467 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD180Q99467 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD180Q99467 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD180Q99467 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD180Q99467 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD180Q99467 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD180Q99467 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD180Q99467 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD180Q99467 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD180Q99467 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD180Q99467 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD180Q99467 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD180Q99467 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD180Q99467 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD180Q99467 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD180Q99467 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD180Q99467 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD180Q99467 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD180Q99467 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD180Q99467 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD180Q99467 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD180Q99467 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD180Q99467 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD180Q99467 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD180Q99467 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD180Q99467 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD180Q99467 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD180Q99467 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD180Q99467 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD180Q99467 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD180Q99467 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD180Q99467 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD180Q99467 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD180Q99467 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD180Q99467 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD180Q99467 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD180Q99467 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD180Q99467 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD180Q99467 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD180Q99467 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD180Q99467 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD180Q99467 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD180Q99467 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD180Q99467 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD180Q99467 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD180Q99467 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD180Q99467 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD180Q99467 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD180Q99467 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD180Q99467 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD180Q99467 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD180Q99467 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD180Q99467 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD180Q99467 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD180Q99467 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD180Q99467 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD180Q99467 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD180Q99467 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD180Q99467 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD180Q99467 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD180Q99467 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms