Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT12Q99456 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms