Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK1Q96SB4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK1Q96SB4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms