Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PANX3Q96QZ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PANX3Q96QZ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PANX3Q96QZ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PANX3Q96QZ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PANX3Q96QZ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PANX3Q96QZ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PANX3Q96QZ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms