Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRNT1Q96Q11 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRNT1Q96Q11 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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