Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3BQ96NL0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms