Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SFXN2Q96NB2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN2Q96NB2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms