Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF145Q96MT1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF145Q96MT1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms