Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMCE3Q96MG7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE3Q96MG7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE3Q96MG7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms