Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf85Q96MD7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms