Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC7Q96M83 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC7Q96M83 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC7Q96M83 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC7Q96M83 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms