Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC114Q96M63 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC114Q96M63 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms