Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74BQ96LY2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms