Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM87BQ96K49 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM87BQ96K49 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms