Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC22AQ96IW7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEC22AQ96IW7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms