Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBED3Q96IU2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBED3Q96IU2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms