Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBM17Q96I25 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM17Q96I25 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBM17Q96I25 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM17Q96I25 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms