Protein–RNA interactions for Protein: Q96HG1

SMIM10, Small integral membrane protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10Q96HG1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10Q96HG1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10Q96HG1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms