Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCD1Q96GM5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCD1Q96GM5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms