Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IMP4Q96G21 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMP4Q96G21 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms