Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3IP1Q96FE7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3IP1Q96FE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3IP1Q96FE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms