Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP36Q96EU6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms