Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTERF3Q96E29 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTERF3Q96E29 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTERF3Q96E29 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms