Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
REPS1Q96D71 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REPS1Q96D71 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REPS1Q96D71 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms