Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OPTNQ96CV9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms