Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms