Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RUNDC1Q96C34 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
RUNDC1Q96C34 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RUNDC1Q96C34 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RUNDC1Q96C34 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms