Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMIGD2Q96BF3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms