Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC74AQ96AQ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74AQ96AQ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74AQ96AQ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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