Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NKD2Q969F2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKD2Q969F2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms