Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DPF3Q92784 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DPF3Q92784 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DPF3Q92784 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms