Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT9Q92600 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms