Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC1Q92574 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSC1Q92574 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms