Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms