Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCSTNQ92542 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms