Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPDL3BQ92485 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3BQ92485 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms