Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C11orf40Q8WZ69 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C11orf40Q8WZ69 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C11orf40Q8WZ69 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C11orf40Q8WZ69 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms