Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSPC1Q8WXF1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSPC1Q8WXF1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPC1Q8WXF1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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