Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC7Q8WUI4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms