Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSC4DQ8WTU2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms