Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP33Q8TEY7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
USP33Q8TEY7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms